tissueTreg

DOI:10.18129 / B9.bioc.tissueTreg

这是发展tissueTreg版本;稳定的发布版本,请参阅tissueTreg。

TWGBS和RNA-seq数据组织T调节细胞从老鼠

Bioconductor版本:发展(3.18)

包提供了准备使用表观基因组(来自TWGBS)和转录组(RNA-seq)从研究中获得的各种组织(PMID Delacher Imbusch 2017: 28783152)。调节性T细胞(Treg细胞)执行两种不同的功能:他们保持自我耐受性,支持器官内稳态Treg细胞分化到专业组织。底层数据集的特征,表观遗传和专业组织Treg细胞转录组修改。

作者:查尔斯Imbusch (aut (cre),迈克尔·Delacher (aut),马库斯Feuerer (aut) Benedikt Brors (aut)

维护人员:查尔斯Imbusch < c。在dkfz.de imbusch >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“tissueTreg”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	ExperimentData,Mus_musculus_Data,RNASeqData,SequencingData,组织
版本	1.21.0
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 3.5)
进口
链接
建议	BiocStyle,rmarkdown knitr testthat,ExperimentHub,bsseq,SummarizedExperiment
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/cimbusch/tissueTreg
取决于我
进口我
建议我	DMRcate
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tissueTreg
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ tissueTreg
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/tissueTreg/
包下载报告	下载数据