timecoursedata

DOI:10.18129 / B9.bioc.timecoursedata

这是发展timecoursedata版本;稳定的发布版本,请参阅timecoursedata。

一个数据包timecourse RNA-seq和微阵列基因表达数据集

Bioconductor版本:发展(3.18)

这个包包含timecourse基因表达数据集的数据。第一个数据集,从鞋匠等,由微阵列的小鼠肺组织样本暴露于不同influenzy株来自14个时间点。另外两个数据集是高粱作物的叶和根样本暴露在预处理和post-flowering干旱胁迫和控制条件,整个植物生命周期采样。

作者:伊丽莎白Purdom (aut),内尔Varoquaux (aut (cre)

维护人员:内尔Varoquaux <内尔。在gmail.com varoquaux >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“timecoursedata”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“timecoursedata”)

HTML	R脚本	timecoursedata:时间进程的基因表达数据集
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	ExperimentData,ExpressionData,MicroarrayData,RNASeqData
版本	1.11.0
许可证	BSD 3条款许可协议+文件许可证
取决于	R (> = 4.0),SummarizedExperiment
进口
链接
建议	testthat (> = 1.0.0)、knitr rmarkdown,减价,covr,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我	moanin
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	timecoursedata_1.11.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/timecoursedata
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ timecoursedata
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/timecoursedata/
包下载报告	下载数据