鞑靼

DOI:10.18129 / B9.bioc.tartare

这是发展鞑靼的版本;稳定版请参见鞑靼．

在赛默飞世尔科学质谱仪上记录的原始地面光谱

Bioconductor版本:开发(3.17)

提供在不同的液相色谱质谱(LC-MS)仪器上记录的原始文件。所有包括的MS仪器都是由赛默飞世尔科学公司制造的，属于Orbitrap Tribrid或Q Exactive Orbitrap仪器家族。尽管它们有共同的起源和共享的硬件组件，例如。，Orbitrap mass analyser, the above instruments tend to write data in different "dialects" in a shared binary file format (.raw). The intention behind tartare is to provide complex but slim real-world files that can be used to make code robust with respect to this diversity. In other words, it is intended for enhanced unit testing. The package is considered to be used with the rawrr package and the Spectra MsBackends.

作者:Christian Panse [aut, cre]，托拜厄斯·科克曼[aut]

维护者:Christian Panse

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install(" tartarare ")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“鞑靼”)

超文本标记语言	R脚本	制作和使用鞑靼数据
PDF		参考手册

细节

biocViews	ExperimentData，ExperimentHub，MassSpectrometryData
版本	1.13.0
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 4.1)，AnnotationHub(> = 2.16),ExperimentHub(> = 1.0)
进口	跑龙套
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，testthat、工具
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/cpanse/tartare
BugReports	https://github.com/cpanse/tartare/issues
全靠我
进口我
建议我	MsBackendRawFileReader，rawrr
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	tartare_1.13.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制文件(x86_64)
macOS二进制文件(arm64)
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tartare
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/tartar
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/tartare/
软件包下载报告	下载数据