这是发展spatialDmelxsim版本;稳定的发布版本,请参阅spatialDmelxsim。
Bioconductor版本:发展(3.18)
空间等位基因表达式计数从梳子和弗雷泽(2018),编译成一个SummarizedExperiment对象。这个包包含的等位基因表达数据项空间片飞胚胎,黑腹果蝇x果蝇simulans十字架。看到的引用文件数据源,和相关的脚本从公开数据对象是如何构造的。
作者:迈克尔·爱(aut (cre)
维修工:迈克尔爱< michaelisaiahlove gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“spatialDmelxsim”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“spatialDmelxsim”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“spatialDmelxsim”)
HTML | R脚本 | spatialDmelxsim |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | Drosophila_melanogaster_Data,ExperimentData,ExperimentHub,ExpressionData,地理,RNASeqData,SequencingData |
版本 | 1.7.1上 |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (> = 4.1),ExperimentHub,SummarizedExperiment |
进口 | 跑龙套 |
链接 | |
建议 | knitr rmarkdown,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/mikelove/spatialDmelxsim |
BugReports | https://github.com/mikelove/spatialDmelxsim/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | spatialDmelxsim_1.7.1.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS二进制(x86_64) | |
macOS二进制(arm64) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/spatialDmelxsim |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ spatialDmelxsim |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/spatialDmelxsim/ |
包下载报告 | 下载数据 |