- 家
- Bioconductor 3.18
- 实验方案
- shinyMethylData(开发版)
shinyMethylData
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DOI:10.18129 / B9.bioc.shinyMethylData
这是发展shinyMethylData版本;稳定的发布版本,请参阅shinyMethylData。
为shinyMethyl示例数据集的输入数据
Bioconductor版本:发展(3.18)
提取的数据从369年TCGA头部和颈部癌症的DNA甲基化样本。提取的数据作为一个示例数据集包shinyMethyl。原始样品从450 k甲基化数组,并获得癌症基因组图谱(TCGA)。310个样本来自肿瘤,50匹配法线和9的技术复制控制细胞系。
作者:让-菲利普•福丁(cre, aut], Kasper丹尼尔·汉森(aut)
维护人员:让-菲利普•福丁< jfortin jhsph.edu >
从内部引用(R,回车引用(“shinyMethylData”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“shinyMethylData”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
| 参考手册 |
细节
| biocViews | CancerData,ExperimentData,基因组 |
| 版本 | 1.21.0 |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (> = 3.0.0) |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | shinyMethyl |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | shinyMethylData_1.21.0.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| macOS二进制(x86_64) | |
| macOS二进制(arm64) | |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/shinyMethylData |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ shinyMethylData |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/shinyMethylData/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
