sesameData

DOI:10.18129 / B9.bioc.sesameData

这是发展sesameData版本;稳定版请参见sesameData

SeSAMe包的支持数据

Bioconductor版本:开发(3.17)

为SeSAMe包提供支持注释和测试数据。这包括芯片探戈地址、映射信息、性能注释和Infinium阵列数据的训练预测器。该包为用户提供了使用Infinium DNA甲基化阵列的许多代工作的基本注释数据。目前我们支持人类阵列(HM27, HM450, EPIC),鼠标阵列(MM285)和HorvathMethylChip40 (Mammal40)阵列。

作者:周婉定[aut, cre],沈晖[aut],蒂莫西[ctb]

维护:Wanding Zhou

引文(从R内,输入引用(“sesameData”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("sesameData")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“sesameData”)

超文本标记语言 R脚本 芝麻数据用户指南
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews ExperimentDataExperimentHub基因组MethylationArrayDataMicroarrayData
版本 1.17.3
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 4.2.0),ExperimentHubAnnotationHub
进口 跑龙套,readrstringrGenomicRangesS4VectorsIRangesGenomeInfoDb
链接
建议 BiocGenerics芝麻testthatknitrrmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我 芝麻
进口我 MethReg
建议我 埃尔默
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 sesameData_1.17.3.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制文件(x86_64)
macOS二进制文件(arm64)
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sesameData
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/sesameData
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/sesameData/
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  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网