这是发展sesameData版本;稳定版请参见sesameData.
Bioconductor版本:开发(3.17)
为SeSAMe包提供支持注释和测试数据。这包括芯片探戈地址、映射信息、性能注释和Infinium阵列数据的训练预测器。该包为用户提供了使用Infinium DNA甲基化阵列的许多代工作的基本注释数据。目前我们支持人类阵列(HM27, HM450, EPIC),鼠标阵列(MM285)和HorvathMethylChip40 (Mammal40)阵列。
作者:周婉定[aut, cre],沈晖[aut],蒂莫西[ctb]
维护:Wanding Zhou
引文(从R内,输入引用(“sesameData”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.3”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("sesameData")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“sesameData”)
超文本标记语言 | R脚本 | 芝麻数据用户指南 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | ExperimentData,ExperimentHub,基因组,MethylationArrayData,MicroarrayData |
版本 | 1.17.3 |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 4.2.0),ExperimentHub,AnnotationHub |
进口 | 跑龙套,readr,stringr,GenomicRanges,S4Vectors,IRanges,GenomeInfoDb |
链接 | |
建议 | BiocGenerics,芝麻,testthat,knitr,rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | 芝麻 |
进口我 | MethReg |
建议我 | 埃尔默 |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | sesameData_1.17.3.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS二进制文件(x86_64) | |
macOS二进制文件(arm64) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sesameData |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/sesameData |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/sesameData/ |
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