scpdata

DOI:10.18129 / B9.bioc.scpdata

这是发展scpdata的版本;稳定版请参见scpdata．

单细胞蛋白质组学数据包

Bioconductor版本:开发(3.17)

该软件包传播基于质谱(MS)的单细胞蛋白质组学(SCP)数据集。数据从已发表的作品中收集，并使用“scp”数据结构进行格式化。数据集包含单细胞或分钟样本量的光谱、肽和/或蛋白质水平的定量信息。

作者:Christophe Vanderaa [aut, cre]，洛朗·加托[au]

维护者:Christophe Vanderaa < Christophe。范德达在uclouvain.be>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("scpdata")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“scpdata”)

超文本标记语言	R脚本	单细胞蛋白质组学数据包
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ExperimentData，ExperimentHub，ExpressionData，MassSpectrometryData，PackageTypeData，蛋白质组，ReproducibleResearch，SingleCellData
版本	1.7.0
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 4.2.0)，QFeatures，ExperimentHub
进口	跑龙套,AnnotationHub，SingleCellExperiment，S4Vectors
链接
建议	scp，magrittr，dplyr，knitr，BiocStyle，BiocCheck，rmarkdown，testthat
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	scpdata_1.7.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制文件(x86_64)
macOS二进制文件(arm64)
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scpdata
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/scpdata
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/scpdata/
软件包下载报告	下载数据