msdata

DOI:10.18129 / B9.bioc.msdata

这是发展msdata版本;稳定的发布版本,请参阅msdata。

各种质谱分析的原始数据文件示例

Bioconductor版本:发展(3.16)

离子阱积极mzML电离模式数据文件格式。子集从500 - 850 m / z 1190 - 1310秒,包括,一,MS3强度阈值100.000。摘录FTICR顶点三世,m / z 400 - 450。的子集UPLC -力量micrOTOFq数据,mzML和mz5。LC-MSMS和MRM文件从蛋白质组学实验。PSI mzIdentML示例文件为各种搜索引擎。

作者:史蒂芬诺伊曼在ipb-halle.de > < sneumann。劳伦与<劳伦。与在uclouvain.be >with contriutions from Johannes Rainer

维护人员:史蒂芬诺伊曼在ipb-halle.de > < sneumann。劳伦与<劳伦。与在uclouvain.be >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“msdata”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ExperimentData,MassSpectrometryData
版本	0.37.0
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 3.5.0)
进口
链接
建议	xcms,mzR,MSnbase
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我	首次公开募股,MetaboAnnotation,MobilityTransformR,MSnbase,msqrob2,mzR,peakPantheR,PSMatch,QFeatures,RforProteomics,光谱,TargetDecoy,xcms
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	msdata_0.37.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/msdata
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ msdata
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/msdata/
包下载报告	下载数据