leeBamViews

DOI:10.18129 / B9.bioc.leeBamViews

这是发展leeBamViews版本;稳定的发布版本,请参阅leeBamViews

leeBamViews——摘自李2009多个酵母RNAseq样本

Bioconductor版本:发展(3.16)

数据从PMID 19096707;原型用于管理多个门店样本

作者:VJ凯里< stvjc channing.harvard.edu >

维修工:VJ凯里< stvjc channing.harvard.edu >

从内部引用(R,回车引用(“leeBamViews”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“leeBamViews”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“leeBamViews”)

PDF R脚本 管理多个门店与bamViews样本
PDF 参考手册

细节

biocViews ExperimentData,RNASeqData,SNPData,Saccharomyces_cerevisiae_Data,SequencingData
版本 1.33.0
许可证 艺术2.0
取决于 R (> = 2.15.0),Biobase,Rsamtools(> = 0.1.50),BSgenome
进口 GenomicRanges,GenomicAlignments、方法、S4Vectors平行,IRanges
链接
建议 biomaRt,org.Sc.sgd.db,刨边机
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我 EDASeq
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 leeBamViews_1.33.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/leeBamViews
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ leeBamViews
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/leeBamViews/
包下载报告 下载数据

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