这是发展leeBamViews版本;稳定的发布版本,请参阅leeBamViews。
Bioconductor版本:发展(3.16)
数据从PMID 19096707;原型用于管理多个门店样本
作者:VJ凯里< stvjc channing.harvard.edu >
维修工:VJ凯里< stvjc channing.harvard.edu >
从内部引用(R,回车引用(“leeBamViews”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“leeBamViews”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“leeBamViews”)
R脚本 | 管理多个门店与bamViews样本 | |
参考手册 |
biocViews | ExperimentData,RNASeqData,SNPData,Saccharomyces_cerevisiae_Data,SequencingData |
版本 | 1.33.0 |
许可证 | 艺术2.0 |
取决于 | R (> = 2.15.0),Biobase,Rsamtools(> = 0.1.50),BSgenome |
进口 | GenomicRanges,GenomicAlignments、方法、S4Vectors平行,IRanges |
链接 | |
建议 | biomaRt,org.Sc.sgd.db,刨边机 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | EDASeq |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | leeBamViews_1.33.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS二进制(x86_64) | |
macOS二进制(arm64) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/leeBamViews |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ leeBamViews |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/leeBamViews/ |
包下载报告 | 下载数据 |