这是发展版本的gageData;稳定版请参见gageData.
Bioconductor版本:开发(3.17)
这是一个支持软件包的软件包,gage。然而,这里提供的数据一般也适用于基因集或通路分析或微阵列数据分析。在这个包中,我们提供了两个演示微阵列数据集:GSE16873(来自GEO的乳腺癌数据集)和BMP6(最初作为GAGE的演示数据集发布,也在GEO中注册为GSE13604)。该软件包还包括基于KEGG途径和主要研究物种(包括人类、小鼠、大鼠和出芽酵母)的GO术语的常用基因集数据。还包括出芽酵母常见基因id之间的映射数据。
作者:罗维钧
维护者:Weijun Luo < Luo Weijun at yahoo.com>
引文(从R内,输入引用(“gageData”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.3”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("gageData")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | BreastCancerData,CancerData,ExperimentData,地理,MicroarrayData,干细胞的 |
版本 | 2.37.0 |
许可证 | GPL (> = 2.0) |
取决于 | R (>= 2.10) |
进口 | |
链接 | |
建议 | 计,pathview,genefilter |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | 计 |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | gageData_2.37.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS二进制文件(x86_64) | |
macOS二进制文件(arm64) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gageData |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/gageData |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/gageData/ |
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