ewceData

DOI:10.18129 / B9.bioc.ewceData

这是发展ewceData版本;稳定的发布版本,请参阅ewceData。

ewce所需ewceData包提供了参考数据

Bioconductor版本:发展(3.17)

这个包ewce所需提供了参考数据。表达式加权Celltype浓缩(EWCE)是用来确定哪些细胞类型中丰富基因列表。包提供了工具测试充实在简单的基因列表(如人类疾病相关基因)和微分表达式产生的那些研究。包不依赖于任何特定的单细胞转录组数据集和用户定义的数据集可以加载和使用的分析。

作者:艾伦·墨菲(cre),内森斯基恩(aut)

维修工:艾伦·墨菲在hotmail.com < alanmurph94 >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“ewceData”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“ewceData”)

HTML	R脚本	数据加权Celltype浓缩EWCE包表达式
PDF		参考手册

细节

biocViews	ExperimentData,ExperimentHub,ExpressionData,基因组,MicroarrayData,蛋白质组,RNASeqData,SequencingData,SingleCellData
版本	1.7.1上
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 4.1),ExperimentHub
进口
链接
建议	knitr,BiocStyle,ggplot2,cowplot,rmarkdown,减价,testthat(> = 3.0.0)
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/neurogenomics/ewceData
取决于我
进口我	EWCE
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	ewceData_1.7.1.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ewceData
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ewceData
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ewceData/
包下载报告	下载数据