curatedTBData

DOI:10.18129 / B9.bioc.curatedTBData

这是发展curatedTBData版本;稳定的发布版本,请参阅curatedTBData。

管理现有49个肺结核的转录组研究

Bioconductor版本:发展(3.18)

curatedTBData R包提供标准化,策划结核病(TB)转录组研究。最初的发布包包含49个研究。curatedTBData包允许用户访问更有效的结核病trancriptomic高效跨多个数据集比较不同结核病基因签名。

作者:Xutao王(aut (cre), w·埃文约翰逊(aut),普拉萨德帕蒂尔(aut)

维护人员:王Xutao < xutaow bu.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“curatedTBData”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“curatedTBData”)

HTML	R脚本	curatedTBData
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	ExperimentData,ExperimentHub,地理,Homo_sapiens_Data
版本	1.7.0
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 4.1.0)
进口	AnnotationHub,ExperimentHub,MultiAssayExperimentrlang,统计数据
链接
建议	BiocStyle,DT, dplyr HGNChelper knitr,方法,rmarkdown,SummarizedExperiment,股东价值分析,testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/compbiomed/curatedTBData
BugReports	https://github.com/compbiomed/curatedTBData/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	curatedTBData_1.7.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/curatedTBData
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ curatedTBData
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/curatedTBData/
包下载报告	下载数据