chipseqDBData

DOI:10.18129 / B9.bioc.chipseqDBData

这是发展chipseqDBData版本;稳定的发布版本,请参阅chipseqDBData。

数据chipseqDB工作流

Bioconductor版本:发展(3.16)

排序和索引文件的BAM ChIP-seq库,用于chipseqDB工作流。BAM指标也包括在内。

作者:亚伦Lun (aut (cre)

维护人员:亚伦Lun < infinite.monkeys.with。键盘在gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“chipseqDBData”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“chipseqDBData”)

HTML	R脚本	文件清单和统计
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ChIPSeqData,ExperimentData,ExperimentHub,SequencingData
版本	1.13.0
许可证	CC 4.0
取决于
进口	AnnotationHub,ExperimentHub,Rsamtools,S4Vectors
链接
建议	knitr,BiocStyle,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	csawBook
进口我
建议我	chipseqDB
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	chipseqDBData_1.13.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/chipseqDBData
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ chipseqDBData
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/chipseqDBData/
包下载报告	下载数据