celldex

DOI:10.18129 / B9.bioc.celldex

这是发展celldex版本;稳定版请参见celldex．

单元格类型参考索引

Bioconductor版本:开发(3.16)

提供一个参考表达数据集的集合与策画的细胞类型标签，用于单细胞数据的自动注释或散装RNA-seq反卷积的过程。

作者:Dvir Aran [aut]， Aaron Lun [aut, cre, cph]， Daniel Bunis [aut]， Jared Andrews [aut]， Friederike Dündar [aut]

维护者:Aaron Lun 的键盘

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("celldex")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“celldex”)

超文本标记语言	R脚本	单元格类型引用
PDF		参考手册

细节

biocViews	ExperimentData，ExperimentHub，ExpressionData，RNASeqData，SequencingData
版本	1.7.0
许可证	GPL-3
取决于	SummarizedExperiment
进口	跑龙套,ExperimentHub，AnnotationHub，AnnotationDbi，S4Vectors，DelayedArray，DelayedMatrixStats
链接
建议	testthat，knitr，rmarkdown，BiocStyle，DT
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/LTLA/celldex
BugReports	https://support.bioconductor.org/
全靠我	OSCA。工作流,SingleRBook
进口我	singleCellTK
建议我	ontoProc，单，tidySingleCellExperiment
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	celldex_1.7.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/celldex
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/celldex
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/celldex/
软件包下载报告	下载数据