ccTutorial

DOI:10.18129 / B9.bioc.ccTutorial

这是发展ccTutorial版本;稳定的发布版本,请参阅ccTutorial。

数据包ChIP-chip教程

Bioconductor版本:发展(3.17)

这个数据包伴随ChIP-chip教程,已经发表在PLoS计算生物学。这个包中的数据和源代码允许读者完全复制本教程中的步骤。

作者:Joern Toedling,沃尔夫冈•休伯

维护人员:Joern Toedling < Joern。在curie.fr toedling >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“ccTutorial”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“ccTutorial”)

PDF	R脚本	关于如何分析的教程使用Bioconductor ChIP-chip读数
PDF	R脚本	补充一个教程如何分析使用Bioconductor ChIP-chip读数
PDF		参考手册

细节

biocViews	ChipOnChipData,ExperimentData,MicroarrayData,Mus_musculus_Data
版本	1.37.0
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 2.10),林格(> = 1.9.8),affy(> = 1.23.4),topGO(> = 1.13.1)
进口	Biobase
链接
建议	biomaRt,Biobase(> = 2.5.5),xtable
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	ccTutorial_1.37.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ccTutorial
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ccTutorial
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ccTutorial/
包下载报告	下载数据