这是发展bodymapRat版本;稳定的发布版本,请参阅bodymapRat。
Bioconductor版本:发展(3.18)
这个包包含一个SummarizedExperiment Yu et al。(2013),进行大鼠BodyMap 11个器官和4个发展阶段。生FASTQ文件下载并使用明星映射。ExperimentHub数据作为数据方案。
作者:斯蒂芬妮·希克斯(aut (cre),夸梅Okrah (aut)
维护人员:斯蒂芬妮·希克斯< shicks19 jhu.edu >
从内部引用(R,回车引用(“bodymapRat”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“bodymapRat”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“bodymapRat”)
HTML | R脚本 | bodymapRat数据用户指南 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | ExperimentData,ExperimentHub,ExpressionData,RNASeqData,SequencingData |
版本 | 1.17.0 |
许可证 | CC 4.0 |
取决于 | R (> = 3.6.0),SummarizedExperiment,ExperimentHub |
进口 | 跑龙套 |
链接 | |
建议 | rmarkdown knitr,BiocStyle,testthat |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | qsmooth |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | bodymapRat_1.17.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS二进制(x86_64) | |
macOS二进制(arm64) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bodymapRat |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ bodymapRat |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/bodymapRat/ |
包下载报告 | 下载数据 |