这是发展WGSmapp版本;稳定的发布版本,请参阅WGSmapp。
Bioconductor版本:发展(3.17)
这个包提供了全基因组mappability追踪人类hg19 / hg38组装。我们使用100 -即mappability跟踪从编码的项目和计算加权平均mappability相同的分数如果多个编码区域重叠。“黑名单”垃圾箱,包括音从端粒重复区域和空白参考组装,着丝粒和/或异染色质区域包括在内。数据集由三个组装本文件单细胞全基因组测序从10 x出于演示目的。
作者:如金王
维护人员:如金王<如金在email.unc.edu >
从内部引用(R,回车引用(“WGSmapp”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“WGSmapp”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DNASeqData,编码,ExperimentData,基因组,Homo_sapiens_Data,SequencingData,SingleCellData |
版本 | 1.11.0 |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R (> = 3.6.0),GenomicRanges |
进口 | |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | 范围 |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | WGSmapp_1.11.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS二进制(x86_64) | |
macOS二进制(arm64) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/WGSmapp |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ WGSmapp |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/WGSmapp/ |
包下载报告 | 下载数据 |