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- VariantToolsData(开发版)
VariantToolsData
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DOI:10.18129 / B9.bioc.VariantToolsData
这是发展VariantToolsData版本;稳定的发布版本,请参阅VariantToolsData。
数据VariantTools教程
Bioconductor版本:发展(3.17)
数据从50/50的人类基因组单体型图三的混合物样品的测序NA12878 (CEU)和NA19240(套),TP53地区子集。
作者:迈克尔•劳伦斯
维护人员:迈克尔·劳伦斯< michafla gene.com >
从内部引用(R,回车引用(“VariantToolsData”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“VariantToolsData”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“VariantToolsData”)
| R脚本 | VariantTools示例数据 | |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | ExperimentData,人类基因组单体型图,SNPData,SequencingData |
| 版本 | 1.23.0 |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (> = 3.5.0),VariantAnnotation(> = 1.7.35) |
| 进口 | BiocGenerics,GenomicRanges |
| 链接 | |
| 建议 | VariantTools(> = 1.3.4),gmapR(> = 1.3.3),BiocStyle |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | VariantToolsData_1.23.0.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| macOS二进制(x86_64) | |
| macOS二进制(arm64) | |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/VariantToolsData |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ VariantToolsData |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/VariantToolsData/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
