- 家
- Bioconductor 3.17
- 实验方案
- TCGAWorkflowData(开发版)
TCGAWorkflowData
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DOI:10.18129 / B9.bioc.TCGAWorkflowData
这是发展TCGAWorkflowData版本;稳定的发布版本,请参阅TCGAWorkflowData。
数据,TCGA工作流
Bioconductor版本:发展(3.17)
这个实验数据包包含11个数据集必须遵循“TCGA工作流:分析癌症基因组学和表观基因组学数据使用Bioconductor包”。
作者:蒂亚戈席尔瓦Chedraoui < tiagochst在usp.br >
维修工:蒂亚戈Chedraoui席尔瓦< tiagochst在usp.br >
从内部引用(R,回车引用(“TCGAWorkflowData”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“TCGAWorkflowData”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“TCGAWorkflowData”)
| HTML | R脚本 | TCGA的示例数据工作流:分析癌症基因组和表观基因组学数据使用Bioconductor包” |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | CancerData,ExperimentData,Homo_sapiens_Data,MicroarrayData |
| 版本 | 1.23.0 |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (> = 3.5.0) |
| 进口 | SummarizedExperiment |
| 链接 | |
| 建议 | knitr,rmarkdown,老鸨,testthat |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://f1000research.com/articles/5-1542/v2 |
| BugReports | https://github.com/BioinformaticsFMRP/TCGAWorkflow/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | TCGAWorkflow |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | TCGAWorkflowData_1.23.0.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| macOS二进制(x86_64) | |
| macOS二进制(arm64) | |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TCGAWorkflowData |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ TCGAWorkflowData |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/TCGAWorkflowData/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
