SFEData

DOI:10.18129 / B9.bioc.SFEData

这是发展SFEData版本;稳定的发布版本,请参阅SFEData。

SpatialFeatureExperiment示例数据集

Bioconductor版本:发展(3.18)

例子空间转录组数据集与简单的功能注释SpatialFeatureExperiment对象。技术包括Visium、slide-seq Nanostring CoxMX, Vizgen MERFISH,和10 x赠与宾客的礼物。组织包括小鼠骨骼肌、人类黑色素瘤转移,人类肺癌、乳腺癌和老鼠的肝脏。

作者:λ摩西(aut (cre)凯拉杰克逊(aut)黑色,Lior Pachter (aut)

维护人员:摩西λ< dlu2 caltech.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“SFEData”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“SFEData”)

HTML	R脚本	SpatialFeatureExperiment示例数据集
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ExperimentData,ExperimentHub,ExpressionData,Homo_sapiens_Data,Mus_musculus_Data,SingleCellData,SpatialData,组织
版本	1.3.0
许可证	艺术- 2.0
取决于
进口	BiocFileCache,AnnotationHub,ExperimentHub
链接
建议	BiocStyleknitr rmarkdown,SpatialFeatureExperimenttestthat (> = 3.0.0)
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/pachterlab/SFEData
BugReports	https://github.com/pachterlab/SFEData/issues
取决于我
进口我
建议我	SpatialFeatureExperiment,“航行者”号
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	SFEData_1.3.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SFEData
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SFEData
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/SFEData/
包下载报告	下载数据