- 家
- Bioconductor 3.17
- 实验方案
- SCATEData(开发版)
SCATEData
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DOI:10.18129 / B9.bioc.SCATEData
这是发展SCATEData版本;稳定的发布版本,请参阅SCATEData。
数据SCATE(单细胞ATAC-seq信号提取和增强)
Bioconductor版本:发展(3.17)
SCATEData是SCATE ExperimentHub包是一个软件工具,提取和提高稀疏和离散单细胞ATAC-seq信号。
作者:至诚霁(aut)、周(aut) Wenpin侯(cre, aut)
,Hongkai霁(aut)
维护人员:Wenpin侯< wp。在gmail.com hou3 >
从内部引用(R,回车引用(“SCATEData”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“SCATEData”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“SCATEData”)
| HTML | R脚本 | 1。SCATEData包 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | ExperimentData,ExperimentHub |
| 版本 | 1.9.0 |
| 许可证 | 麻省理工学院+文件许可证 |
| 取决于 | R (> = 3.5.0),ExperimentHub,GenomicAlignments,GenomicRanges、基础 |
| 进口 | 跑龙套 |
| 链接 | |
| 建议 | knitr,rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| BugReports | https://github.com/Winnie09/SCATEData/issues |
| 取决于我 | SCATE |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | SCATEData_1.9.0.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| macOS二进制(x86_64) | |
| macOS二进制(arm64) | |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SCATEData |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SCATEData |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/SCATEData/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
