SBGNview.data

DOI:10.18129 / B9.bioc.SBGNview.data

这是发展SBGNview.data版本;稳定的发布版本,请参阅SBGNview.data。

支持数据集SBGNview包

Bioconductor版本:发展(3.17)

这个包包含:1。微阵列基因表达数据集从人类乳腺癌的研究。2。RNA-Seq基因表达数据集从一只老鼠研究IFNG淘汰赛。3所示。ID基因之间的映射表ID和SBGN-ML文件符号ID。4所示。百分比在其他物种的发现直接同源基因的途径。切断这个百分比定义如果通路存在于另一个物种。5。 XML text of SBGN-ML files for all pre-collected pathways.

作者:小希盾*,Kovidh Vegesna *, Weijun罗

维护人员:Weijun罗< luo_weijun yahoo.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“SBGNview.data”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“SBGNview.data”)

HTML	R脚本	支持数据集SBGNview包
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	BreastCancerData,CancerData,ExperimentData,地理,MicroarrayData,RNASeqData
版本	1.13.0
许可证	AGPL-3
取决于	R (> = 3.6)
进口	knitr,rmarkdown,bookdown
链接
建议	SummarizedExperiment
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	SBGNview
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	SBGNview.data_1.13.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SBGNview.data
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SBGNview.data
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/SBGNview.data/
包下载报告	下载数据