rforpoteomics

doi：10.18129/b9.bioc.rforpoteomics

这是发展Rforpoteomics的版本；对于稳定版本，请参阅rforpoteomics。

伴侣包给“使用R和生物导体进行蛋白质组学数据分析”出版物

生物导体版本：开发（3.16）

该软件包包含代码，以说明使用R和Bioconductor手稿对蛋白质组学数据分析进行蛋白质组学数据分析的“使用R和Bioconductor”和“可视化”。小插图描述了复制论文中描述的示例和数字所需的代码和数据以及蛋白质组学可视化的功能。它还包含各种功能，以发现用于质谱和蛋白质组学的R软件。

作者：Laurent Gatto [AUT，CRE]，Sebastian Gibb [CTB]，Vlad Petyuk [CTB]，Thomas Pedersen Lin [CTB]

维护者：laurent Gatto

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ rforproteomics”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

PDF		参考手册

细节

生物浏览	实验数据，，，，群众光谱，，，，reproducibleresearch
版本	1.35.0
执照	艺术2.0
要看	r（> = 3.5），MSNBase（> = 2.5.3）
进口	r.utils，，，，生物浏览，，，，生物管理器
链接
建议	AnnotationDbi，，，，rpx（> = 2.0.3），DT，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，生物使用，，，，MZR，，，，XCMS，，，，MSDATA，，，，isobar，，，，害怕（> = 1.12），马尔德方外，，，，readbrukerflexdata，，，，rdisop，，，，orgmassspecr，，，，总结性特征，，，，脑，，，，洛尔，，，，HPAR，，，，go.db，，，，org.hs.eg.db，，，，E1071，，，，Biomart，，，，rcolorbrewer，，，，GGPLOT2，，，，RESHAPE2，，，，Xtable，，，，格子，，，，mzid，，，，proloc，，，，prolocdata，，，，MSNID，，，，msmstests，，，，MSMSEDA，，，，dep，，，，Corrplot，，，，beanplot，，，，热倍，，，，GPLOTS，，，，Venndiagram，，，，PROTVIZ，，，，GeneFilter，，，，情节，，，，栅格，，，，dplyr，，，，橄榄酸，，，，魔术，，，，切肉刀
系统要求
增强
URL	http://lgatto.github.com/rforproteomics/
取决于我
进口我
建议我	MSSTATSQC
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包
Windows二进制
MacOS 10.13（高山脉）
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rforproteomics
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/rforpoteomics
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/rforproteomics/
软件包下载报告	下载统计