- 家
- Bioconductor 3.18
- 实验方案
- RTCGA.miRNASeq(development version)
RTCGA.miRNASeq
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DOI:10.18129 / B9.bioc.RTCGA.miRNASeq
这是发展RTCGA.miRNASeq版本;稳定的发布版本,请参阅RTCGA.miRNASeq。
从癌症基因组图谱项目miRNASeq数据集
Bioconductor版本:发展(3.18)
包提供miRNASeq数据集从癌症基因组图谱项目所有可用的队列类型从http://gdac.broadinstitute.org/。数据格式是解释这里https://wiki.nci.nih.gov/display/TCGA/miRNASeq miRNASeq-DataOverview 2015-11-01的数据快照。
作者:维特尔Chodor < witoldchodor gmail.com >
维修工:戈辛斯<一下。辛斯gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“RTCGA.miRNASeq”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“RTCGA.miRNASeq”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“RTCGA.miRNASeq”)
| HTML | R脚本 | 使用RTCGA下载miRNASeq数据包含在RTCGA.miRNASeq |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | AnnotationData,ExperimentData |
| 版本 | 1.29.0 |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | R (> = 3.3.0),RTCGA |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | knitr, rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| BugReports | https://github.com/RTCGA/RTCGA/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | RTCGA |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | RTCGA.miRNASeq_1.29.0.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| macOS二进制(x86_64) | |
| macOS二进制(arm64) | |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RTCGA.miRNASeq |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ RTCGA.miRNASeq |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/RTCGA.miRNASeq/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
