RTCGA.methylation

DOI:10.18129 / B9.bioc.RTCGA.methylation

这是发展RTCGA.methylation版本;稳定的发布版本,请参阅RTCGA.methylation。

癌症基因组的甲基化数据集Atlas项目

Bioconductor版本:发展(3.16)

包提供甲基化(humanmethylation27)数据集从癌症基因组图谱项目所有可用的队列类型从http://gdac.broadinstitute.org/。数据格式是解释这里https://wiki.nci.nih.gov/display/TCGA/DNA从2015-11-01 +甲基化数据快照。

作者:戈库辛斯基(aut (cre) Witold Chodor (aut)

维修工:戈辛斯<一下。辛斯gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“RTCGA.methylation”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“RTCGA.methylation”)

HTML	R脚本	使用RTCGA甲基化数据包含在RTCGA.methylation下载
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	AnnotationData,ExperimentData
版本	1.25.0
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 3.3.0),RTCGA
进口
链接
建议	knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/RTCGA/RTCGA/issues
取决于我
进口我
建议我	RTCGA
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	RTCGA.methylation_1.25.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RTCGA.methylation
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ RTCGA.methylation
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/RTCGA.methylation/
包下载报告	下载数据