- 家
- Bioconductor 3.17
- 实验方案
- RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14(development version)
RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14
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DOI:10.18129 / B9.bioc.RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14
这是发展RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14版本;稳定的发布版本,请参阅RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14。
对齐读取从RNAseq实验:高通量测序转录剖析的HNRNPC击倒和控制海拉细胞
Bioconductor版本:发展(3.17)
包包含8 BAM文件,1 /测序运行。每个BAM文件是通过(1)调整读取(paired-end)与TopHat2完整hg19基因组,然后(2)构造子集只保留chr14比对。看到加入数字e - mtab - 1147 ArrayExpress数据库中有关实验的细节,包括链接到发表的研究(Zarnack et al ., 2012)和FASTQ文件。
作者:Herve页面
维护人员:< hpages.on Herve页面。github在gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
| 参考手册 |
细节
| biocViews | ArrayExpress,ExperimentData,地理,基因组,Homo_sapiens_Data,NCI,RNASeqData,SequencingData |
| 版本 | 0.37.0 |
| 许可证 | LGPL |
| 取决于 | |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | GenomicAlignments,BiocManager |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | http://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-MTAB-1147/ |
| 取决于我 | 测序 |
| 进口我 | |
| 建议我 | BiocParallel,GenomicAlignments,GenomicFiles,GenomicRanges,咆哮,Rsamtools,SplicingGraphs |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14_0.37.0.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| macOS二进制(x86_64) | |
| macOS二进制(arm64) | |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14 |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
