这是发展ObMiTi版本;要使用它,请安装猛击版本Bioconductor。
生物导体版本:开发(3.13)
该包提供2株小家鼠RNA-seq计数;野生型和Ob/Ob。每个品系被分为两组,每组喂食饲料或高脂饲料。12周后检测7个组织中RNA的表达。
作者:Omar Elashkar,马哈茂德·艾哈迈德[aut]
维护人员:Omar Elashkar < Omar i。在gmail.com elashkar >
引文(从R中输入引用(“ObMiTi”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("ObMiTi")
有关较旧版本的R,请参阅适当的Bioconductor释放。
要查看系统中安装的软件包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“ObMiTi”)
超文本标记语言 | R脚本 | 使用ObMiTi |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | ExperimentData,ExperimentHub,地理,RNASeqData |
版本 | 0.99.7 |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (> = 4.1),SummarizedExperiment,ExperimentHub |
进口 | |
链接 | |
建议 | knitr,rmarkdown,BiocManager,GenomicFeatures,S4Vectors,devtools,testthat |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/OmarElAshkar/ObMiTi |
BugReports | https://github.com/OmarElAshkar/ObMiTi/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | ObMiTi_0.99.7.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS 10.13 (High Sierra) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ObMiTi |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ObMiTi |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ObMiTi/ |
包下载报告 | 下载数据 |