这是发展MouseGastrulationData版本;稳定版请参见MouseGastrulationData.
Bioconductor版本:开发(3.16)
为单细胞RNA测序、单细胞ATAC-seq和seqFISH(空间转录组学)实验提供处理过的原始计数数据,这些实验沿着小鼠原肠形成和早期器官发生的时间过程进行。
作者:Jonathan Griffiths [aut, cre], Aaron Lun [aut]
维护者:Jonathan Griffiths < Jonathan . Griffiths。94在gmail.com>
引文(从R内,输入引用(“MouseGastrulationData”)
):
要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("MouseGastrulationData")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“MouseGastrulationData”)
超文本标记语言 | R脚本 | 可用的数据集 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | ExperimentData,ExperimentHub,ExpressionData,Mus_musculus_Data,RNASeqData,SequencingData,SingleCellData |
版本 | 1.11.0 |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (>= 4.1),SingleCellExperiment,SummarizedExperiment,SpatialExperiment |
进口 | 方法,ExperimentHub,BiocGenerics,S4Vectors,BumpyMatrix |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/MarioniLab/MouseGastrulationData |
BugReports | https://github.com/MarioniLab/MouseGastrulationData/issues |
全靠我 | OSCA.multisample |
进口我 | |
建议我 | miloR |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | MouseGastrulationData_1.11.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS 10.13 (High Sierra) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MouseGastrulationData |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MouseGastrulationData |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/MouseGastrulationData/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |