MethylSeqData

DOI:10.18129 / B9.bioc.MethylSeqData

这是发展MethylSeqData版本;稳定版请参见MethylSeqData．

收集公共DNA甲基化测序数据集

Bioconductor版本:开发(3.17)

基本水平(即胞嘧啶水平)的亚硫酸根序列公共数据集(例如，WGBS和RRBS)的计数，作为带有样本和基本水平元数据的summarize实验对象提供。

作者:Peter Hickey [aut, cre]

维护者:Peter Hickey < Peter。Hickey在gmail.com>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("MethylSeqData")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“MethylSeqData”)

超文本标记语言	R脚本	用户指南
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ExperimentData，ExperimentHub，Homo_sapiens_Data，MethylSeqData，Mus_musculus_Data，SequencingData
版本	1.9.0
许可证	CC0
取决于	SummarizedExperiment
进口	ExperimentHub，HDF5Array，rhdf5，GenomeInfoDb，S4Vectors，GenomicRanges统计数据,IRanges,跑龙套
链接
建议	BiocFileCache，BiocStyle，data.table，knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	MethylSeqData_1.9.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制文件(x86_64)
macOS二进制文件(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MethylSeqData
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MethylSeqData
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MethylSeqData/
软件包下载报告	下载数据