- 家
- Bioconductor 3.18
- 实验方案
- MMDiffBamSubset(开发版)
MMDiffBamSubset
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DOI:10.18129 / B9.bioc.MMDiffBamSubset
这是发展MMDiffBamSubset版本;稳定的发布版本,请参阅MMDiffBamSubset。
例子ChIP-Seq MMDiff包的数据
Bioconductor版本:发展(3.18)
BAM的子集文件,包括WT_2。bam, Null_2。bam, Resc_2。bam,输入。从“Cfp1”实验bam(参见Clouaire et al .,基因Dev。2012)。下数据可用ArrayExpress加入数字e - erad - 79。此外,相应的山峰的子集称为mac
作者:Gabriele Schweikert
维护人员:Gabriele Schweikert < G。在ed.ac.uk Schweikert >
从内部引用(R,回车引用(“MMDiffBamSubset”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“MMDiffBamSubset”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
| 参考手册 |
细节
| biocViews | ArrayExpress,ChIPSeqData,DNASeqData,ExperimentData,基因组,Mus_musculus_Data,干细胞的 |
| 版本 | 1.37.0 |
| 许可证 | LGPL |
| 取决于 | |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | MMDiff2 |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | MMDiff2 |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | MMDiffBamSubset_1.37.0.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| macOS二进制(x86_64) | |
| macOS二进制(arm64) | |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MMDiffBamSubset |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MMDiffBamSubset |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/MMDiffBamSubset/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
