HighlyReplicatedRNASeq

DOI:10.18129 / B9.bioc.HighlyReplicatedRNASeq

这是发展HighlyReplicatedRNASeq版本;稳定的发布版本,请参阅HighlyReplicatedRNASeq。

收集的大部分RNA-Seq与许多复制实验

Bioconductor版本:发展(3.18)

能够计算矩阵数据批量RNA-seq与许多复制数据集。提供的数据是容易使用SummarizedExperiment对象。使其能够通过这个包访问源数据来自https://github.com/bartongroup/profDGE48。

作者:江诗丹顿Ahlmann-Eltze (aut (cre)

维护人员:江诗丹顿Ahlmann-Eltze < artjom31415 googlemail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“HighlyReplicatedRNASeq”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“HighlyReplicatedRNASeq”)

HTML	R脚本	探索86散装RNA-seq样本Schurch et al。(2016)的研究
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	ExperimentData,ExperimentHub,ExpressionData,RNASeqData,SequencingData
版本	1.13.0
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	SummarizedExperiment,ExperimentHub
进口	S4Vectors
链接
建议	BiocStyle,BiocFileCache、knitr rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/const-ae/HighlyReplicatedRNASeq
BugReports	https://github.com/const-ae/HighlyReplicatedRNASeq/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	HighlyReplicatedRNASeq_1.13.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HighlyReplicatedRNASeq
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ HighlyReplicatedRNASeq
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/HighlyReplicatedRNASeq/
包下载报告	下载数据