这是发展HiContactsData版本;稳定的发布版本,请参阅HiContactsData。
Bioconductor版本:发展(3.18)
提供了一组高c文件(对,(m)冷却和fastq)。这些数据集可以读成R和进一步研究和可视化HiContacts包。生成的数据包括酵母高c数据Koszul巴斯德研究所的实验室。
作者:雅克Serizay (aut (cre)
维护人员:雅克Serizay < jacquesserizay gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“HiContactsData”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“HiContactsData”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“HiContactsData”)
HTML | R脚本 | HiContactsData |
参考手册 | ||
文本 | 许可证 |
biocViews | ExperimentData,ExperimentHub,SequencingData |
版本 | 1.3.0 |
许可证 | 麻省理工学院+文件许可证 |
取决于 | ExperimentHub |
进口 | BiocFileCache,AnnotationHub |
链接 | |
建议 | testthat、方法BiocStyle、knitr rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/js2264/HiContactsData |
BugReports | https://github.com/js2264/HiContactsData/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | HiCExperiment,HiContacts,HiCool |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | HiContactsData_1.3.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS二进制(x86_64) | |
macOS二进制(arm64) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HiContactsData |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ HiContactsData |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/HiContactsData/ |
包下载报告 | 下载数据 |