HarmanData

DOI:10.18129 / B9.bioc.HarmanData

这是发展HarmanData版本;稳定的发布版本,请参阅HarmanData。

哈曼包的数据

Bioconductor版本:发展(3.18)

数据集的陪哈曼,基于PCA和约束优化技术。包含三个示例数据集:IMR90,人类肺成纤维细胞暴露于一氧化氮;NPM,一个实验来测试皮肤渗透后的金属氧化物纳米颗粒在没有怀孕小鼠局部应用防晒霜;OLF;一个实验来衡量人类嗅觉的响应neurosphere-derived(荣誉)细胞氧化锌纳米颗粒。自从1.24版本,这个包还包含Infinium5数据集,一组批校正调整在5 Illumina公司英飞纳姆甲基化BeadChip数据集。这个文件不包含甲基化数据,但是总结统计5校正后的数据集。还有一个EpiSCOPE_sample文件作为样板在哈曼新的甲基化聚类功能。

作者:Yalchin Oytam (aut),乔什·鲍登(aut),贾森·罗斯(aut (cre)

维修工:杰森·罗斯<杰森。罗斯在csiro.au >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“HarmanData”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“HarmanData”)

HTML	R脚本	HarmanData
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ExperimentData,ExpressionData,Homo_sapiens_Data,MicroarrayData,Mus_musculus_Data
版本	1.29.0
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.5.0)
进口
链接
建议	BiocGenerics,BiocStyleknitr rmarkdown,哈曼(> = 1.23.3)
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.bioinformatics.csiro.au/harman/
取决于我
进口我
建议我	哈曼
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	HarmanData_1.29.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HarmanData
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ HarmanData
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/HarmanData/
包下载报告	下载数据