HCADATA

doi:10.18129/b9.bioc.hcadata

这是发展Hcadata的版本;对于稳定版本,请参阅HCADATA

访问R/Bioconductor中人类细胞地图集的数据集

生物导体版本:开发(3.16)

该软件包允许直接访问由人类小组Atlas项目生成的数据集,以在R和Bioconductor中进行进一步处理,以舒适的singlecellexpermiment对象的舒适格式(以其他格式提供:http://preview.data.humancellatlas.orgg/)。

作者:费德里科·马里尼(Federico Marini)[AUT,CRE]

维护者:uni-mainz.de>的Federico Marini

引用(从r内,输入引用(“ hcadata”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version ='devel')biocmanager :: install(“ hcadata”)的用法

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Hcadata”)

html R脚本 访问人类细胞图集数据集
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 实验数据,,,,实验室,,,,表达数据,,,,rnaseqdata,,,,Singlecelldata
版本 1.13.0
执照 麻省理工学院 +文件执照
要看 r(> = 3.6),Singlecellexperiment
进口 实验室,,,,AnnotationHub,,,,HDF5Array,UTILS
链接
建议 尼特,,,,rmarkDown,,,,生物使用,,,,斯克兰(> = 1.11.4),生物兴奋,,,,评分,,,,砍伐,,,,RTSNE,,,,Igraph,,,,我明白,,,,测试
系统要求
增强
URL https://github.com/federicomarini/hcadata
取决于我 OSCA.Workflows
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 hcadata_1.13.0.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.13(高山脉)
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/hcadata
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/hcadata
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/hcadata/
软件包下载报告 下载统计

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