GSE62944

DOI:10.18129 / B9.bioc.GSE62944

这是发展GSE62944版本;稳定的发布版本,请参阅GSE62944。

加入地理数据GSE62944 SummarizedExperiment

Bioconductor版本:发展(3.17)

TCGA RNA-Seq数据处理9264肿瘤和741年24正常样本的癌症类型,使他们可以加入地理(GSE62944) (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE62944)。GSE62944数据解析成ExperimentHub SummarizedExperiment对象可用。

作者:Sonali Arora

维修工:Bioconductor包维护者<维护者bioconductor.org >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“GSE62944”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“GSE62944”)

HTML	R脚本	使用Bioconductor ExperimentHub TCGA的原始数据
PDF		参考手册

细节

biocViews	DNASeqData,ExperimentData,基因组,RNASeqData
版本	1.27.0
许可证	艺术- 2.0
取决于	Biobase,GEOquery
进口
链接
建议	ExperimentHub(> = 0.99.6),knitr,BiocStyle,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/release/bioc/html/GSE62944.html
取决于我
进口我
建议我	GSEABenchmarkeR
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	GSE62944_1.27.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GSE62944
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GSE62944
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GSE62944/
包下载报告	下载数据