GSE159526

DOI:10.18129 / B9.bioc.GSE159526

这是发展GSE159526版本;稳定的发布版本,请参阅GSE159526。

从加入地理GSE159526胎盘细胞DNA甲基化数据

Bioconductor版本:发展(3.17)

19项和9早期妊娠胎盘绒毛膜绒毛和匹配cell-sorted样本Illumina公司HumanMethylationEPIC DNA甲基化芯片。这个数据是可用在GEO加入(GSE159526) (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE159526)。原材料数据一直在可用{ExperimentHub} \代码。原始未经处理的数据格式化作为集成和标准化的RGChannelSet对象使用minfi和其他现有Bioconductor包。规范化数据处理也可作为一个DNA甲基化矩阵{}\代码,与相应的表型信息作为\ {data.frame}对象代码。

作者:维克多元(aut (cre)

维护人员:维克多元<维克多。2王寅gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“GSE159526”)

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文档

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browseVignettes (“GSE159526”)

HTML	R脚本	介绍GSE159526
PDF		参考手册
文本		许可证

细节

biocViews	ExperimentData,ExperimentHub,地理,基因组,Homo_sapiens_Data,MethylationArrayData,组织
版本	1.5.0
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于
进口
链接
建议	ExperimentHub,BiocStyle,RefManageR,knitr,rmarkdown,testthat,minfi,宠物猫,sessioninfo
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/wvictor14/GSE159526
BugReports	https://github.com/wvictor14/GSE159526/issues
取决于我
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包档案

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源包	GSE159526_1.5.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GSE159526
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GSE159526
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GSE159526/
包下载报告	下载数据