这是发展EpiMix.data版本;要使用它,请安装猛击版本Bioconductor。
Bioconductor版本:开发(3.16)
EpiMix R包支持数据。包括:—HM450_lncRNA_probes。rda - HM450_miRNA_probes。rda - EPIC_lncRNA_probes。rda - EPIC_miRNA_probes。rda -表观基因组图谱。rda - LUAD.sample.annotation - TCGA_BatchData - MET。data - mRNA。data - microRNA。data - lncRNA。data - Sample_EpiMixResults_lncRNA - Sample_EpiMixResults_miRNA - Sample_EpiMixResults_Regular -存储在ExperimentHub中的TCGA肿瘤的lncRNA表达数据。
作者:郑元宁[aut, cre]
维护人员:郑元宁
引文(从R内,输入引用(“EpiMix.data”)
):
要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("EpiMix.data")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“EpiMix.data”)
超文本标记语言 | R脚本 | 装饰图案 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | ExperimentData,ExperimentHub,ExpressionData,基因组,RNASeqData |
版本 | 0.99.3 |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (>= 4.2.0),ExperimentHub(> = 0.99.6) |
进口 | |
链接 | |
建议 | rmarkdown,knitr |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
BugReports | https://github.com/gevaertlab/EpiMix/issues |
全靠我 | EpiMix |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | EpiMix.data_0.99.3.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS 10.13 (High Sierra) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/EpiMix.data |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/EpiMix.data |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/EpiMix.data/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |