这是发展DuoClustering2018版本;稳定的发布版本,请参阅DuoClustering2018。
Bioconductor版本:发展(3.17)
预处理实验和模拟scRNA-seq数据集用于评价聚类方法scRNA-seq Duo et al(2018)中的数据。还包含结果的几种聚类方法应用到每一个数据集,为策划方法和功能性能。
作者:安吉洛双核,夏洛特Soneson
维护人员:安吉洛二<安吉洛。两人在icloud.com >
从内部引用(R,回车引用(“DuoClustering2018”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“DuoClustering2018”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“DuoClustering2018”)
HTML | R脚本 | 应用聚类方法 |
HTML | R脚本 | 情节表现总结 |
HTML | R脚本 | 可视化数据集与iSEE和聚类结果 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | ExperimentData,SingleCellData |
版本 | 1.17.0 |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | |
进口 | ExperimentHub跑龙套,magrittr,dplyr,tidyr,mclust,ggplot2,purrr,reshape2,冬青,ggthemes、统计数据、方法 |
链接 | |
建议 | knitr,rmarkdown,BiocStyle,iSEE,嘘,SingleCellExperiment,SummarizedExperiment,plyr |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | 科拉尔,用水晶球占卜 |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | DuoClustering2018_1.17.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS二进制(x86_64) | |
macOS二进制(arm64) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DuoClustering2018 |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ DuoClustering2018 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/DuoClustering2018/ |
包下载报告 | 下载数据 |