DropletTestFiles

DOI:10.18129 / B9.bioc.DropletTestFiles

这是发展DropletTestFiles版本;稳定的发布版本,请参阅DropletTestFiles。

测试文件为单细胞滴实用工具

Bioconductor版本:发展(3.17)

生成各种文件从droplet-based单细胞协议,用于在DropletUtils测试功能。主要用于存储文件,直接处理管道的10倍基因组学”CellRanger软件,形成之前SingleCellExperiment对象。不像其他的包,这不是旨在提供对象立即准备分析。

作者:亚伦Lun(施,cre)

维护人员:亚伦Lun < infinite.monkeys.with。键盘在gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“DropletTestFiles”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“DropletTestFiles”)

HTML	R脚本	测试文件droplet-based单细胞实用工具
PDF		参考手册

细节

biocViews	ExperimentData,ExperimentHub,ExpressionData,RNASeqData,SequencingData,SingleCellData
版本	1.9.0
许可证	GPL-3
取决于
进口	跑龙套,ExperimentHub,AnnotationHub,S4Vectors
链接
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown,testthat,DropletUtils
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	OSCA。先进,OSCA.intro OSCA.workflows
进口我
建议我	DropletUtils,TENxIO
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	DropletTestFiles_1.9.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DropletTestFiles
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ DropletTestFiles
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/DropletTestFiles/
包下载报告	下载数据