DAPARdata

DOI:10.18129 / B9.bioc.DAPARdata

这是发展DAPARdata版本;稳定的发布版本,请参阅DAPARdata。

伴随DAPAR和Prostar包的数据

Bioconductor版本:发展(3.17)

质谱仪通过UPS蛋白质组学数据集从分支C, Hovasse, Marcellin M,黑森州,Mouton-Barbosa E, Bouyssie D, Vaca年代,Carapito C, Chaoui K, Bruley C,加林J, Cianferani S, M,铁Dorssaeler AV, Burlet-Schiltz O, Schaeffer C,滑道值Y,冈萨雷斯Peredo A飙升蛋白质组标准数据集进行测试label-free定量软件和统计方法。短暂的数据。2015年12月17日;6:286 - 94和Giai Gianetto, Q。梳子,F。支,C。,Bruley, C., Coute, Y., Burger, T. (2016). Calibration plot for proteomics: A graphical tool to visually check the assumptions underlying FDR control in quantitative experiments. Proteomics, 16(1), 29-32.

作者:佛罗伦萨梳(aut),撒母耳Wieczorek (cre, aut)

维护人员:塞缪尔Wieczorek <撒母耳。wieczorek在cea.fr >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“DAPARdata”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“DAPARdata”)

PDF	R脚本	DAPARdata用户手册
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ExperimentData,MassSpectrometryData,蛋白质组
版本	1.29.0
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 4.2.0),MSnbase
进口	跑龙套
链接
建议	knitr,DAPAR
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.prostar-proteomics.org/
BugReports	https://github.com/prostarproteomics/DAPARdata/issues
取决于我
进口我	DAPAR,Prostar
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	DAPARdata_1.29.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DAPARdata
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ DAPARdata
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/DAPARdata/
包下载报告	下载数据