CopyhelpeR

DOI:10.18129 / B9.bioc.CopyhelpeR

这是发展CopyhelpeR版本;稳定的发布版本,请参阅CopyhelpeR。

Helper文件文案

Bioconductor版本:发展(3.17)

这个包包含helper文件运行Bioconductor所需包装文案。它包含预1 kb本GC-content及mappability文件参考基因组hg18 hg19, hg38, mm9 mm10。此外,它包含一个黑名单过滤去除区域显示CNV。文件存储为农庄对象从GenomicRanges Bioconductor包。

作者:托马斯Kuilman

维护人员:奥斯卡Krijgsman < o.krijgsman在nki.nl >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“CopyhelpeR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“CopyhelpeR”)

PDF	R脚本	CopyhelpeR
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ExperimentData,GenomicSequence,Homo_sapiens
版本	1.31.0
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 3.5.0)
进口
链接
建议	BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我	文案
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	CopyhelpeR_1.31.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CopyhelpeR
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ CopyhelpeR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/CopyhelpeR/
包下载报告	下载数据