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- Bioconductor 3.17
- 实验方案
- ChIPexoQualExample(开发版)
ChIPexoQualExample
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DOI:10.18129 / B9.bioc.ChIPexoQualExample
这是发展ChIPexoQualExample版本;稳定的发布版本,请参阅ChIPexoQualExample。
ChIPexoQual包示例数据,实现了一个质量控制管道ChIP-exo数据
Bioconductor版本:发展(3.17)
数据ChIPexoQual包,(3)组成的染色体1一致读ChIP-exo实验在鼠肝细胞系对齐FoxA1 mm9基因组。
作者:雷内·韦尔奇,东峻涌Sunduz凯尔
维护人员:雷内·韦尔奇韦尔奇< stat.wisc.edu >
从内部引用(R,回车引用(“ChIPexoQualExample”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“ChIPexoQualExample”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“ChIPexoQualExample”)
| HTML | R脚本 | ChIPexoQualExample |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | ExperimentData,基因组 |
| 版本 | 1.23.0 |
| 许可证 | GPL (> = 2) |
| 取决于 | R (> = 3.3) |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | http://www.github.com/keleslab/ChIPexoQualExample |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | ChIPexoQual |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | ChIPexoQualExample_1.23.0.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| macOS二进制(x86_64) | |
| macOS二进制(arm64) | |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ChIPexoQualExample |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ChIPexoQualExample |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ChIPexoQualExample/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
