这是发展CLLmethylation版本;稳定的发布版本,请参阅CLLmethylation。
Bioconductor版本:发展(3.18)
包包括DNA甲基化数据主要的慢性淋巴细胞白血病样本包含在主血癌百科全书(速度)项目。原始数据从450 k DNA甲基化数组存储在欧洲Genome-Phenome存档(EGA)加入EGAS0000100174数量。关于这个项目的更多信息请参阅本文“血癌Drug-perturbation-based分层”到迪特里希年代,ole M, Lu J。J .中国。投资。(2018)和R / BloodCancerMultiOmics2017 Bioconductor包。
作者:马格达雷娜ole,安德烈亚斯模拟
维护人员:马格达雷娜ole < dr.malgorzata。ole gmail.com >安德烈模拟<安德烈亚斯。嘲笑embl.de >
从内部引用(R,回车引用(“CLLmethylation”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“CLLmethylation”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“CLLmethylation”)
HTML | R脚本 | CLLmethylation |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | CancerData,DiseaseModel,ExperimentData,LeukemiaCancerData |
版本 | 1.21.0 |
许可证 | LGPL |
取决于 | R (> = 3.5.0) |
进口 | SummarizedExperiment,ExperimentHub |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr ggplot2 rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | CLLmethylation_1.21.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS二进制(x86_64) | |
macOS二进制(arm64) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CLLmethylation |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ CLLmethylation |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/CLLmethylation/ |
包下载报告 | 下载数据 |