targetscan.Mm.eg.db

DOI:10.18129 / B9.bioc.targetscan.Mm.eg.db

这是发展targetscan.Mm.eg.db;稳定版请参见targetscan.Mm.eg.db．

TargetScan小鼠miRNA靶点预测

Bioconductor版本:开发(3.17)

TargetScan miRNA目标预测使用TargetScan网站的数据组装的小鼠。TargetScan通过搜索与每个miRNA的种子区域相匹配的保守的8mer和7mer位点来预测miRNA的生物学靶点。此外，还发现了种子区域的错配位点，这些错配位点通过保守的3'配对得到补偿。在哺乳动物中，预测是基于预测的靶向效果进行排名的，这是通过使用站点的上下文分数计算得出的。

作者:Gabor Csardi

维护者:James F. Reid < James。里德在ifom-ieo-campus.it>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("targetscan. mm . e.g. .db")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

PDF		参考手册
文本		许可证

细节

biocViews	AnnotationData，FunctionalAnnotation
版本	0.6.1
许可证	文件许可证
取决于	R(>= 2.7.0)，方法，AnnotationDbi(> = 1.18.3)
进口	方法,AnnotationDbi
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	targetscan.Mm.eg.db_0.6.1.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制文件(x86_64)
macOS二进制文件(arm64)
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/targetscan.Mm.eg.db/
软件包下载报告	下载数据