这是发展代谢物映射的版本;对于稳定版本,请参阅代谢物图。
生物导体版本:开发(3.16)
该软件包提供了九种不同代谢物ID格式及其通用名称的全面映射表。数据已从四个公开可用来源收集并合并,包括HMDB,Comptox仪表板,Chebi和Graphite Bioconductor R软件包。
作者:Sebastian Canzler [AUT,CRE]
维护者:塞巴斯蒂安·坎兹勒(Sebastian Canzler)<塞巴斯蒂安(Sebastian)。
引用(从r内,输入引用(“代谢物映射”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ ageboliteIdmapping”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“代谢物映射”)
html | R脚本 | 代谢物图 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | AnnotationData,,,,AnnotationHub,,,,CustomDbschema,,,,函数通道 |
版本 | 1.0.0 |
执照 | GPL-3 |
要看 | R(> = 4.0.0) |
进口 | AnnotationHub |
链接 | |
建议 | 马格里特,,,,石墨,,,,dplyr,,,,花花公子,,,,蒂布尔,,,,Rappdirs,,,,XML,,,,readxl,,,,Stringr,utils,尼特,,,,套,,,,r.utils,,,,readr,,,,冲突,,,,rmarkDown |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/yigbt/metaboliteidmapping |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | 多人 |
链接到我 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | ageaboliteMapping_1.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
MacOS 10.13(高山脉) | |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/metaboliteidmapping/ |
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