这是发展hpAnnot版本;稳定的发布版本,请参阅hpAnnot。
Bioconductor版本:发展(3.18)
包包含示例和注释数据Hipathia包。Hipathia是计算的方法从转录组数据的信号转导信号通路。方法是基于迭代算法可以计算出通过一个网络节点的信号强度考虑每一个基因的表达水平和信号的强度。它还提供了一种新方法功能分析允许计算信号到达每个通路的功能注释。Hipathia取决于这个包功能。
作者:玛尔塔·r·伊达尔戈(aut (cre),何塞Carbonell-Caballero[所有],旧金山Salavert[所有],艾丽西亚Amadoz[所有],Cankut Cubuk[所有],华金Dopazo(施)
维修工:玛尔塔·r·伊达尔戈<玛尔塔。伊达尔戈在outlook.es >
从内部引用(R,回车引用(“hpAnnot”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“hpAnnot”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“hpAnnot”)
R脚本 | hpAnnot | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | AnnotationData,CustomDBSchema,FunctionalAnnotation,PackageType |
版本 | 1.1.0 |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R (> = 3.5) |
进口 | |
链接 | |
建议 | BiocStyle、knitr rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | hpAnnot_1.1.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS二进制(x86_64) | |
macOS二进制(arm64) | |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/hpAnnot/ |
包下载报告 | 下载数据 |