排除

doi:10.18129/b9.bioc.excluderanges

这是发展版本的dubluderanges;对于稳定版本,请参阅排除

有问题的基因组区域的基因组坐标

生物导体版本:开发(3.16)

有问题的基因组区域的基因组坐标应避免使用基因组数据。排除区域(以前称为黑名单),centromeres,端粒,已知的异染色质区域等(UCSC'GAP'表数据)。主要用于人类和小鼠基因组,HG19/HG38和MM9/MM10基因组组件。

作者:Mikhail Dozmorov [AUT,CRE],埃里克·戴维斯(Eric Davis)[aut],Wancen Mu [Aut],Stuart Lee [Aut],Tim Triche [Aut],Douglas Phanstiel [AUT],Michael Love [aut]

维护者:mikhail dozmorov

引用(从r内,输入引用(“排除”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ dercorderanges”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“排除”)

html R脚本 排除
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 AnnotationData,,,,AnnotationHub,,,,函数通道,,,,基因组序列
版本 0.99.6
执照 麻省理工学院 +文件执照
要看
进口
链接
建议 生物使用,,,,尼特,,,,Refmanager,,,,rmarkDown,,,,RCGH,,,,SessionInfo,,,,AnnotationHub
系统要求
增强
URL https://github.com/mdozmorov/excluderanges
BugReports https://github.com/mdozmorov/excluderanges/issues
取决于我
进口我
建议我 nullranges
链接到我

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 excluderanges_0.99.6.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.13(高山脉)
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/excluderanges/
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