XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38

DOI:10.18129 / B9.bioc.XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38

这是发展XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38版本;稳定的发布版本,请参阅XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38。

额外的SNP地点智人(dbSNP构建144)

Bioconductor版本:发展(3.18)

额外的SNP等位基因位置和智人从NCBI dbSNP构建144。源数据文件用于这个包是由NCBI 5月30日,2015年,包含snp GRCh38映射到参考基因组。p2 (GRCh38的补丁版本,并不改变染色体22页,X, Y, MT)。而SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144。GRCh38包只包含分子变化类“国民党”,这个包包含其他类的分子变化(named-locus (del、杂合的微卫星,缺乏变化,混合,和multinucleotide-polymorphism)。

作者:Herve页面

维修工:h .页< hpages fhcrc.org >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	AnnotationData,遗传学,Homo_sapiens,XtraSNPlocs
版本	0.99.12
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 2.10),BSgenome
进口	方法,跑龙套,BiocGenerics,S4Vectors,IRanges,GenomeInfoDb,GenomicRanges,BSgenome
链接
建议	Biostrings,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38,SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我	BSgenome
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包档案

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源包	XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38_0.99.12.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38/
包下载报告	下载数据