这个包是弃用。它可能会从生物导体中取出。请参考包装终止指南了解更多信息。
这是发展Xtrasnplocs.hsapiens.dbsnp141.grch38的版本;对于稳定版本,请参阅xtrasnplocs.hsapiens.dbsnp141.grch38。
生物导体版本:开发(3.16)
从NCBI DBSNP构建中提取的HOMO SAPIENS的额外SNP位置和等位基因141.该软件包使用的源数据文件是由NCBI于2014年5月1日创建的,并包含用于参考Genome GRCH38的SNP。虽然snplocs.hsapiens.dbsnp141.grch38套件仅包含“ SNP”类的分子变化,但该软件包包含其他类别的分子变化(In-del,del,杂合,微磷灰石,命名为locus,not-locus,not-locus,no-caliation-not-caliation-coliation-cliation-caliation-Criation-Criation-cribiet&Multinucleiteide-coligletibleide-多氨基纤维纤维透明,多核纤维纤维透明,多核纤维纤维透明,多核纤维纤维纤维素透明质。多态性)。
作者:HervéPagès
维护者:h.pagès
引用(从r内,输入引用(“ xtrasnplocs.hsapiens.dbsnp141.grch38”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化了Bioc Devel Biocmanager :: install(version(version ='devel'')biocmanager :: install(“ xtrasnplocs.hsapiens).dbsnp141.grch38“)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
参考手册 |
生物浏览 | AnnotationData,,,,遗传学,,,,homo_sapiens,,,,Xtrasnplocs |
版本 | 0.99.13 |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | r(> = 2.10),S4VECTORS,,,,iranges,,,,GenomeInfodB,,,,基因组机,,,,BSGENOME(> = 1.35.5) |
进口 | 方法,utils,S4VECTORS,,,,iranges,,,,GenomeInfodB,,,,基因组机,,,,BSGENOME |
链接 | |
建议 | snplocs.hsapiens.dbsnp141.grch38,,,,bsgenome.hsapiens.ncbi.grch38(> = 1.3.19) |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | xtrasnplocs.hsapiens.dbsnp141.grch38_0.99.13.tar.gz |
Windows二进制 | |
MacOS 10.13(高山脉) | |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/xtrasnplocs.hsapiens.dbsnp141.grch38/ |
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