TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene

DOI:10.18129 / B9.bioc.TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene

这是发展TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene版本;稳定的发布版本,请参阅TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene。

注释包TxDb对象(年代)

Bioconductor版本:发展(3.16)

公开注释数据库生成从UCSC的通过揭露这些TxDb对象

作者:马克•卡尔森Bioconductor包维护者<维护者bioconductor.org > (cre)

维修工:Bioconductor包维护者<维护者bioconductor.org >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	AnnotationData,遗传学,Homo_sapiens,TxDb
版本	3.2.2
许可证	艺术- 2.0
取决于	GenomicFeatures(> = 1.21.30)
进口	AnnotationDbi
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	注释,FDb.InfiniumMethylation.hg19,Homo.sapiens,变体,火神
进口我	appreci8R,ChIPQC,ChIPseeker,decompTumor2Sig,希尔达,musicatk,nearBynding,profileplyr,RareVariantVis,rCGH,RgnTX,rGREAT,UMI4Cats,uncoverappLib
建议我	AllelicImbalance,AnnotationDbi,annotatr,ATACseqQC,beadarray,BiocOncoTK,BiocParallel,biomvRCNS,biovizBase,北欧化工,bumphunter,chipenrich.data,ChIPpeakAnno,chromPlot,cpvSNP,CRISPRseek,derfinder,derfinderPlot,EpiCompare,EpiMix,epimutacions,esATAC,弗雷泽,GA4GHclient,GA4GHshiny,计,geneAttribution,《创世纪》,GenomicAlignments,GenomicFeatures,GenomicInteractionNodes,GenomicRanges,GenomicScores,GenVisR,ggbio,gmapR,GRaNIE,groHMM,GUIDEseq,gwascat,HTSeqGenie,InPAS,karyoploteR,桅杆,MesKit,MutationalPatterns,NoRCE,先驱者,网页排名,plotgardener,ProteoDisco,PureCN,R3CPET,ramr,regionReport,RiboProfiling,RLSeq,rtracklayer,SGSeq,SigFuge,spatzie,SplicingGraphs,StructuralVariantAnnotation,SummarizedExperiment,svaNUMT,svaRetro,TCGAutils,TFEA.ChIP,trackViewer,transcriptR,tximport,VariantAnnotation,VariantFiltering
我的链接

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene_3.2.2.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene/
包下载报告	下载数据